（1）基料堆酵處理是上世紀90年代研發的一種技術，當時針對發菌慢、污染率高、病蟲害嚴重三大問題而研究、推廣的發酵技術，堆酵處理的基料的確表現為發菌快、成功率高。但是堆酵過程中，基料產生大量生物熱，其能源的絕大部分均來自基料自身，就是說，基料堆酵的過程，也是一個基料自身營養大量流失的過程，因此，對后期產菇勢必產生不利影響。經試驗，使用棉籽殼原料時，采用熟料制袋或生料直接播種發菌是最佳解決辦法。
（2）生料裝袋播種后，菌種的萌發、菌絲的發展，勢必在菌袋內產生生物熱，尤其在高溫季節發菌，極易發生“燒菌”現象，一旦菌袋內達到42℃，就會形成燒菌，該菌袋則無出菇的可能了，即使在12月至翌年2月的低溫季節為了保溫，而忽視了散熱和通氣，將菌袋碼高數層，甚者覆蓋塑料膜及保溫被之類，任其自然，同樣可以產生燒菌的后果。
