冬季氣溫低，其出菇管理一般都在溫室內進行，由于溫度、營養、水分等諸多因素的影響，冬季雖然平姑生長慢、品質好，但是易發生死菇、不出菇、畸形菇現象，冬季生產平菇由于是在溫室內進行，為保溫的需要，通風次數少，會造成棚內小氣候惡化，極易滋生雜菌及發生病蟲害。為此，平菇冬季出菇期管理要做好以下幾個方面的工作。
平菇屬好氧菌，在出菇期如果棚內二氧化碳濃度超過0.1%，會產生畸形菇，并且抑制菇蕾的分化。所以要定時通風換氣。水份在平菇生產中至關重要。當培養料內含水量低于40%時，很難分化原基，即使分化出了原基也很難長大，此時應適時補水。
一旦發生病蟲害，采用藥物進行防治，所生產出來的平姑很難達到無公害的要求。因此，避免病蟲害的發生要采取“以防為主，以治為輔”的原則。具體做法是：采摘后的死菇、菇根及感染雜菌的菌袋要及時清理出棚，同時搞好環境衛生。在第2茬菇的養菌期噴灑殺菌劑1次，以預防雜菌的滋生。采菇間歇期，用0.2%辛硫磷對棚內死角進行噴灑，殺死蟲卵，以防止春天氣溫回升后蟲害的發生。
采取有效地措施預防病蟲害，加上科學的管理，溫室大棚栽培平菇的效益還是相當可觀的。
